1. Tupã¶
2. Monitoramento do jobs utilizando o xpbs¶
O xpbs é um utilitário gráfico que permite monitorar jobs submetidos aos nós computacionais do Tupã. Ele oferece as mesmas funcionalidades do comando qstat, mas de forma simples, direta e centralizada. Para mais informações, digite "man xpbs" no terminal. Para abrir o xpbs, digite apenas "xpbs" no terminal:
$ xpbs &
Depois de executar o comando "xpbs", será aberta a seguinte janela:
Figura 1 - Janela principal do xpbs
Para que o xpbs funcione de forma adequada, deve-se indicar qual servidor do Tupã deverá ser monitorado. Para isso, clique em "Preferences...". A seguinte janela será aberta:
Figura 2 - Janela de preferências do xpbs
Nesta janela, altere o valor padrão do campo "Server hosts" para eslogin13. Outros valores possíveis são: aux20-eth4 e eslogin13:
Figura 3 - Alterando o valor da variável "Server hosts"
Feito isto, basta clicar em "Ok" e a janela de preferências será fechada. Na janela principal do xpbs, clique em "Auto update..." e na janela que abrir, selecione um tempo de atualização das informações mostradas. O tempo mínimo é de 1 minuto:
Figura 4 - Janela do auto update
Depois de selecionado o tempo desejado, clique em "Start updating", na janela seguinte clique em "Ok" e novamente na janela do auto update, clique em "close window".
Figura 5 - Janela de confirmação do auto update
No passo seguinte, na janela principal do xpbs, podemos clicar em "Manual Update" (senão teremos que aguardar a quantidade de tempo determinada para ao auto update para que as informações sejam atualizadas) para atualizar as informações. Feito isto, no painel "Hosts", clicamos na linha apresentada (neste caso, onde está escrito eslogin13) para obtermos informações sobre este servidor:
Figura 6 - Janela principal do xpbs atualizada após clicar no botão "Manual Update"
Figura 7 - Janela de informações sobre o servidor escolhido (eslogin13)
O mesmo procedimento pode ser feito quando clicamos nos itens disponíveis no painel "Jobs":
Figura 8 - Painel "Jobs" da janela principal do xpbs
Figura 9 - Detalhes do job (neste caso, 566897.eslogin13) selecionado
Fazendo-se o mesmo procedimento no painel "Queues", clicando-se em apenas um "queue" (um fila) ou em clicando-se no botão "Select All" e logo em seguida no botão "details", obtém-se uma visão geral da situação das filas disponíveis no Tupã:
Figura 10 - Detalhes das filas no Tupã
Com o xpbs é possível também criar uma lista de monitoramento de jobs executados. Para isso, na janela principal do xpbs, clique no botão "Track job..." e na janela que se abrir, digite o nome do usuário do qual deseja monitor os jobs. É possível acrescentar vários usuários, mas serão monitorados os jobs apenas no(s) servidore(s) previamente especificados:
Figura 11 - Acrescentando usuários que terão os jobs monitorados
Figura 12 - Acrescentando mais usuários
Para iniciar o monitoramento, clique no botão "start/reset tracking" e depois em "close window" se desejar.
Com isto, quando algum job for terminado ou abortado, o botão "Track job..." na janela principal do xpbs ficará vermelho:
Figura 13 - Botão "Track job..." fica vermelho quando algum job muda de estado
Para verificar os detalhes da ocorrência, basta clicar no botão "Track job..." novamente e na janela que abrir, no(s) nome(s) do(s) job(s) que estiverem na lista "Jobs Found Completed". Para cada jobs que for clicado, aparecerá uma nova janela com os arquivos de log e erro do jobs. Caso nenhum erro tenha ocorrido, o painel de erros estará vazio:
Figura 14 - Painel de out e erro do job selecionado
Vale lembrar que na janela principal do xpbs, no painel inferior "INFO" são mostrado os comandos utilizados para a recuperação das informações mostradas dentro das janelas. Por exemplo, quando clicamos nos itens do painel "Jobs" e clicamos no botão "detail", é executado o comando (por exemplo):
$ qstat -f 566594.eslogin13@eslogin13
Cuja saída é exatamente a mesma informação mostrada pela janela de informações do job:
Job Id: 566594.eslogin13
Job_Name = mod299
Job_Owner = carlos.bastarz@eslogin05-eth0
resources_used.cpupercent = 0
resources_used.cput = 00:00:00
resources_used.mem = 5304kb
resources_used.ncpus = 1
resources_used.vmem = 41436kb
resources_used.walltime = 00:08:30
job_state = R
queue = pesq.micro_high
server = eslogin13
Account_Name = CPTEC
Checkpoint = u
ctime = Fri Jun 8 13:44:51 2012
Error_Path = eslogin05-eth0:/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.basta
rz/G3DVAR/datainout/agcm/model/exec_NMC/mod299.e566594
exec_host = login5/10
exec_vnode = (login5:ncpus=1)
Hold_Types = n
Join_Path = oe
Keep_Files = n
Mail_Points = a
mtime = Fri Jun 8 13:45:07 2012
Output_Path = eslogin05-eth0:/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bast
arz/G3DVAR/datainout/agcm/model/exec_NMC/setout/Out.model.NMC.201101011
2.1339163091.%s.MPI480.T299L64.out
Priority = 0
qtime = Fri Jun 8 13:44:51 2012
Rerunable = True
Resource_List.mpparch = XT
Resource_List.mppdepth = 1
Resource_List.mppnppn = 24
Resource_List.mppwidth = 480
Resource_List.ncpus = 1
Resource_List.nodect = 1
Resource_List.place = pack
Resource_List.select = 1:ncpus=1
Resource_List.walltime = 01:00:00
stime = Fri Jun 8 13:45:07 2012
session_id = 31237
Shell_Path_List = /bin/bash
jobdir = /stornext/home/carlos.bastarz
substate = 42
Variable_List = work_grh_agcm_dataout=/scratchout/grupos/assim_dados/home/c
arlos.bastarz/G3DVAR/datainout/agcm/grh/dataout,
work_pre_agcm_run=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G
3DVAR/datainout/agcm/pre/exec,dirgrads=/opt/grads/2.0.a9/bin,
SmoothTopo=F,JM=450,
dirdata=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/datai
nout/agcm,PBS_O_LANG=en_US.UTF-8,XCURSOR_THEME=DMZ,
INFOPATH=/usr/local/info:/usr/share/info:/usr/info,modelpos=_NMC,
aspa=\',
TVMEMDEBUG_POST_LINK_OPTS= -L/opt/toolworks/totalview.8.9.2/linux-x86-
64/lib -ltvheap_cnl_static,
XDG_DATA_DIRS=/usr/share:/etc/opt/kde3/share:/opt/kde3/share,
GetOzone=T,KMIN=28,HISTSIZE=1000,
CRAY_MPICH2_BASEDIR=/opt/cray/mpt/5.4.3/xt/gemini,
ATP_HOME=/opt/cray/atp/1.4.2,
MANPATH=/opt/cray/mpt/5.4.3/xt/gemini/man/mpich2:/opt/xt-libsci/11.0.0
5/man:/opt/cray/xt-asyncpe/5.07/man:/opt/cray/atp/1.4.2/man:/opt/pgi/12
.2.0/linux86-64/12.2/man:/opt/toolworks/totalview.8.9.2/man:/opt/cray/l
lm/default/man:/opt/pbs/10.4.0.101257/man:/opt/modules/3.2.6.6/man:/usr
/local/man:/usr/share/man:/opt/cray/share/man,PROFILEREAD=true,
subt_obs_run=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/
datarun/obs,
home_model_agcm_source=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm
/model/source,di=01,df=01,KMOUT=64,LABELW=2011010121,LABELI=2011010112,
FROM_HEADER=,
public_bkg=/scratchin/grupos/assim_dados/home/gdad/public/GSI/BKG,
subt_model_agcm_datain=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.basta
rz/G3DVAR/datainout/agcm/model/datain,dw=01,
LIBRARYMODULES=/opt/modules/3.2.6.6/init/.librarymodules:acml:alps:app
rentice2:blcr:dmapp:fftw:ga:gni-headers:hdf5:libfast:mpich1:mrnet:netcd
f:ntk:onesided:petsc:petsc-complex:pmi:portals:rca:trilinos:udreg:ugni:
xpmem:xt-atp:xt-lgdb:xt-libsci:xt-mpt:xt-papi:/etc/opt/cray/modules/sit
e_librarymodules,LABELF=2011010121,
home_model_agcm=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/model,
HOSTNAME=eslogin05,
HOME_suite=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm,
MODULESHOME=/opt/modules/3.2.6.6,
WORK_HOME=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz,
MACHTYPE=x86_64-suse-linux,GROUP=assim_dados,initlz=2,MINICOM=-c on,
subt_obs_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3D
VAR/datainout/obs,CSHEDIT=emacs,LESSOPEN=lessopen.sh %s,
CRAY_UDREG_INCLUDE_OPTS=-I/opt/cray/udreg/2.3.1-1.0400.3778.7.3.gem/in
clude,USER=carlos.bastarz,GSSTEP=0,PGI_VERS_STR=12.2.0,
PGROUPD_LICENSE_FILE=/opt/pgi/license.dat,NDFCT0618=12h,CPU=x86_64,
work_gsi_datain=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3D
VAR/datainout/gsi/datain,
subt_run=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/data
run,
dirfNameOutputNEXT=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G
3DVAR/datainout/agcm/model/dataout/TQ0299L064/2011010118,hold=,TRC=299,
TRUNC=TQ0299,
work_grh_agcm=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVA
R/datainout/agcm/grh,PBS_O_HOST=eslogin05-eth0,
home_run_agcm=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/run,
subt_agcm=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/dat
ainout/agcm,
home_pre_agcm_databcs=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/
pre/databcs,QT_HOME_DIR=/usr/share/desktop-data,
path_in=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/datai
nout/agcm/model/datain,
home_sfc=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm2gsi,
work_agcm=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/da
tainout/agcm,
home_gsi_gsisa=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/gsi/SRC/GSIs
a,XDG_CONFIG_DIRS=/etc/xdg,ANL=GANLNMC2011010112S.unf.TQ0299L064,
work_pre_agcm_databcs=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.basta
rz/G3DVAR/datainout/agcm/pre/databcs,
subt_model_agcm=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DV
AR/datainout/agcm/model,gaussgiven=.TRUE.,
GNU_PRE_COMPILE_OPTS= -march=amdfam10,
agcm_scripts_g3dvar=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/run/scripts/a
gcm_scripts,
_LMFILES_=/opt/modulefiles/modules/3.2.6.6:/opt/modulefiles/pbs/10.4.0
.101257:/opt/cray/xt-asyncpe/default/modulefiles/xtpe-network-gemini:/o
pt/modulefiles/PrgEnv-pgi/3.1.72:/opt/modulefiles/xt-totalview/8.9.2:/o
pt/modulefiles/totalview-support/1.1.2:/opt/modulefiles/pgi/12.2.0:/opt
/cray/xt-asyncpe/default/modulefiles/xtpe-mc12:/opt/modulefiles/tupa2/1
.0.0:/opt/cray/gem/modulefiles/nodestat/2.2-1.0400.28140.5.3.gem:/opt/c
ray/gem/modulefiles/sdb/1.0-1.0400.29394.12.45.gem:/opt/cray/modulefile
s/MySQL/5.0.64-1.0000.4667.20.1:/opt/cray/gem/modulefiles/udreg/2.3.1-1
.0400.3778.7.3.gem:/opt/cray/gem/modulefiles/ugni/2.3-1.0400.4127.5.20.
gem:/opt/cray/gem/modulefiles/gni-headers/2.1-1.0400.4156.6.1.gem:/opt/
cray/gem/modulefiles/dmapp/3.2.1-1.0400.3965.10.63.gem:/opt/cray/gem/mo
dulefiles/xpmem/0.1-2.0400.30792.5.6.gem:/opt/modulefiles/hss-llm/6.0.0
:/opt/modulefiles/admin-modules/1.0.2-1.0400.28857.5.1.gem:/opt/modulef
iles/Base-opts/1.0.2-1.0400.28857.5.1.gem:/opt/cray/modulefiles/atp/1.4
.2:/opt/modulefiles/xt-asyncpe/5.07:/opt/cray/modulefiles/xt-libsci/11.
0.05:/opt/cray/modulefiles/xt-mpich2/5.4.3:/opt/cray/gem/modulefiles/pm
i/3.0.0-1.0000.8661.28.2807.gem,PAGER=less,MODULE_VERSION=3.2.6.6,
home_pos_agcm=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/pos,
LIBSCI_VERSION=11.0.05,
work_gsi_dataout=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3
DVAR/datainout/gsi/dataout,RES=mod299,
CRAY_XPMEM_INCLUDE_OPTS=-I/opt/cray/xpmem/0.1-2.0400.30792.5.6.gem/inc
lude,RESIN=62,QUEUE=pesq,
home_pos_agcm_run=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/pos/
exec,home_pre_agcm=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/pre,
HOME=/stornext/home/carlos.bastarz,total=1,
LD_LIBRARY_PATH=/opt/pgi/12.2.0/linux86-64/12.2/libso:/opt/pgi/12.2.0/
linux86-64/12.2/lib:/opt/cray/llm/default/lib64:/opt/cray/mpt/5.2.2/xt/
seastar/mpich2-pgi/lib:/opt/cray/mpt/5.2.2/xt/seastar/sma/lib64,
WALLTIME=1:00:00,prefi=,FCT=09,ASYNCPE_DIR=/opt/cray/xt-asyncpe/5.07,
G_BROKEN_FILENAMES=1,
home_obs=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/obs,
run_g3dvar=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/run,
GRHDATAOUT=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/da
tainout/agcm/grh/dataout,
public_fix=/scratchin/grupos/assim_dados/home/gdad/public/GSI/FIX,
PGI_PATH=/opt/pgi/12.2.0,NPROC=480,
MODULEPATH=/opt/totalview-support/1.1.2/modulefiles:/opt/cray-xt-modul
efiles:/opt/cray/gem/modulefiles:/opt/cray/xt-asyncpe/default/modulefil
es:/opt/cray/modulefiles:/opt/modulefiles,
public_gsi=/scratchin/grupos/assim_dados/home/gdad/public/GSI,
PBS_O_SYSTEM=Linux,
home_grh_agcm_run=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/grh/
exec,NNTPSERVER=news,PGI_VERSION=12.2,G_FILENAME_ENCODING=@locale\,UTF-8\,
ISO-8859-15\,CP1252,HOST=eslogin05,PBS_O_SHELL=/bin/bash,
subt_gsi_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3D
VAR/datainout/gsi/dataout,
home_cptec_bin=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/bin,
subt_pre_agcm_databcs=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastar
z/G3DVAR/datainout/agcm/pre/databcs,RESOUT=299,
work_gsi=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/dat
ainout/gsi,mf=01,LESSCLOSE=lessclose.sh %s %s,mi=01,
SSH_CLIENT=150.163.144.122 44843 22,mw=01,DK_SAN=,MORE=-sl,
DMAPP_ABORT_ON_ERROR=1,
public_rc=/scratchin/grupos/assim_dados/home/gdad/public/GSI/RC,
PBS_O_HOME=/stornext/home/carlos.bastarz,
home_gsi_src=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/gsi/SRC,
HOSTTYPE=x86_64,DATA=2011010112,ASYNCPE_VERSION=5.07,GrADSOnly=F,
TERM=xterm,runmodel=_NMC,
public_crtm=/scratchin/grupos/assim_dados/home/gdad/public/GSI/REL2,
GrADS=T,PGI=/opt/pgi/12.2.0,LV=64,pbs_server1=eslogin13,
pbs_server2=aux20-eth4,
subt_sfc_run=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/
datarun/interface,
CRAY_MPICH2_DIR=/opt/cray/mpt/5.4.3/xt/gemini/mpich2-pgi/109,
LIBSCI_BASE_DIR=/opt/xt-libsci/11.0.05,pfxgrd=G00450L064,
CRAY_GNI_HEADERS_INCLUDE_OPTS=-I/opt/cray/gni-headers/2.1-1.0400.4156.
6.1.gem/include,eigeninit=.FALSE.,
subt_logs_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3
DVAR/out_log,UTC=12,MODULE_VERSION_STACK=3.2.6.6,
caldate=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/utils/bin/cald
ate.3.0.1,
subt_grh_agcm_run=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3
DVAR/datainout/agcm/grh/exec,cpu_mpi=480,AnlPref=gdas1,
subt_pos_agcm_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastar
z/G3DVAR/datainout/agcm/pos/dataout,
work_gsi_datain_obs=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz
/G3DVAR/datainout/gsi/datain/Obs,
work_model_agcm=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3D
VAR/datainout/agcm/model,GRID=Q,RESO=299,LESSKEY=/etc/lesskey.bin,
MRES=TQ0299L064,AUX_QUEUE=pesq.q,RmGANL=F,
work_obs_run=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datarun/obs,PREFY=NMC,PYTHONSTARTUP=/etc/pythonstart,
work_grh_agcm_run=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G
3DVAR/datainout/agcm/grh/exec,
OLDPWD=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/run,
subt_pre_agcm_datain=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz
/G3DVAR/datainout/agcm/pre/datain,
PWD=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/datainout
/agcm/model/exec_NMC,
public_gdad=/scratchin/grupos/assim_dados/home/gdad/public,
PATHENV=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/run/scripts/agcm_scripts,
CRAY_LD_LIBRARY_PATH=/opt/cray/pmi/3.0.0-1.0000.8661.28.2807.gem/lib64
:/opt/cray/mpt/5.4.3/xt/gemini/mpich2-pgi/109/lib:/opt/xt-libsci/11.0.0
5/pgi/109/mc12/lib,XTOS_VERSION=3.1.72,MPPBS=#PBS -l mppwidth=480,
RCLOCAL_BASEOPTS=true,LESS=-M -I,TRCLV=TQ0299L064,
USERMODULES=/opt/modules/3.2.6.6/init/.usermodules:acml:alps:apprentic
e2:atp:blcr:cce:craypat:dmapp:fftw:ga:gcc:gni-headers:hdf5:intel:libfas
t:mpich1:mrnet:netcdf:ntk:onesided:pathscale:petsc:petsc-complex:pgi:pm
i:portals:PrgEnv-cray:PrgEnv-gnu:PrgEnv-intel:PrgEnv-pathscale:PrgEnv-p
gi:rca:stat:trilinos:udreg:ugni:xpmem:xt-asyncpe:xt-craypat:xt-lgdb:xt-
libsci:xt-mpt:xt-papi:xt-totalview:/etc/opt/cray/modules/site_usermodul
es,TOTALVIEW_SUPPORT_LIB=/opt/totalview-support/1.1.2/lib,
XKEYSYMDB=/usr/share/X11/XKeysymDB,
subt_pos_agcm_run=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3
DVAR/datainout/agcm/pos/exec,SHELL=/bin/bash,
CRAY_MPICH2_ROOTDIR=/opt/cray/mpt/5.4.3/xt,
LESS_ADVANCED_PREPROCESSOR=no,CRAY_CPU_TARGET=mc12,timestep=225,
subt_gsi=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/data
inout/gsi,CRAY_MPICH2_VERSION=5.4.3,
PRGENVMODULES=/opt/modules/3.2.6.6/init/.prgenvmodules:PrgEnv-cray:Prg
Env-gnu:PrgEnv-intel:PrgEnv-pathscale:PrgEnv-pgi,LABELANL=2011010112,
yi=2011,DHFCT=1,
home_pos_agcm_source=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/p
os/source,
CRAY_PMI_POST_LINK_OPTS=-L/opt/cray/pmi/3.0.0-1.0000.8661.28.2807.gem/
lib64,
home_pre_agcm_sources=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/
pre/sources,mgiven=.TRUE.,yf=2011,PREFX=NMC,MPICH_ABORT_ON_ERROR=1,
work_sfc_run=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datarun/interface,PE_ENV=PGI,
PE_PRODUCT_LIST=CRAY_PMI:CRAY_MPICH2:LIBSCI:ASYNCPE:ATP:TOTALVIEW:TOTA
LVIEW-SUPPORT:PGI:CRAY_LLM:CRAY_XPMEM:CRAY_DMAPP:CRAY_UGNI:CRAY_UDREG:X
TPE_MC12,yw=2011,
subt_g3dvar=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR,
ThreadsperMPITASK=1,
subt_pos_agcm=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datainout/agcm/pos,
scripts_g3dvar=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/run/scripts,
ATP_MRNET_COMM_PATH=/opt/cray/atp/1.4.2/bin/atp_mrnet_commnode_wrapper
,
subt_pre_agcm=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datainout/agcm/pre,SSH_SENDS_LOCALE=yes,PREFXI=NMC,PBS_SERVER=eslogin13,
PREFXO=NMC,MAQUI=eslogin05-eth0,MAIL=/var/mail/carlos.bastarz,
SSH_CONNECTION=150.163.144.122 44843 150.163.223.25 22,
TOOLMODULES=/opt/modules/3.2.6.6/init/.toolmodules:apprentice2:atp:cra
ypat:mrnet:stat:xt-craypat:xt-lgdb:xt-papi:xt-totalview:/etc/opt/cray/m
odules/site_toolmodules,
DK_suite2=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/dat
ainout/agcm,GDASOnly=F,
work_run_gsi=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datarun/gsi,PBS_O_LOGNAME=carlos.bastarz,ESWRAP_LOGIN=login5,
CRAY_DMAPP_POST_LINK_OPTS=-L/opt/cray/dmapp/3.2.1-1.0400.3965.10.63.ge
m/lib64,INPUTRC=/etc/inputrc,
work_model_agcm_run=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz
/G3DVAR/datainout/agcm/model/exec,
work_pre_agcm_dataout=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.basta
rz/G3DVAR/datainout/agcm/pre/dataout,ATP_POST_LINK_OPTS=-Wl\,
-L/opt/cray/atp/1.4.2/lib/ -Wl\,-lAtpSigHandler -Wl\,
--undefined=__atpHandlerInstall,
subt_obs_datain=/stornext/grupos/assim_dados/oper/letkf/datainout/obs/
prepbufr,SUBMIT_HOME=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz,
NLV=64,SHLVL=3,
CRAY_UGNI_INCLUDE_OPTS=-I/opt/cray/ugni/2.3-1.0400.4127.5.20.gem/inclu
de,
CRAY_XPMEM_POST_LINK_OPTS=-L/opt/cray/xpmem/0.1-2.0400.30792.5.6.gem/l
ib64,
PBS_O_PATH=/opt/cray/pmi/3.0.0-1.0000.8661.28.2807.gem/bin:/opt/cray/x
t-asyncpe/5.07/bin:/opt/cray/atp/1.4.2/bin:/opt/pgi/12.2.0/linux86-64/1
2.2/bin:/opt/toolworks/totalview.8.9.2/bin:/opt/totalview-support/1.1.2
/bin:/opt/cray/llm/default/bin:/opt/cray/llm/default/etc:/opt/cray/xpme
m/0.1-2.0400.30792.5.6.gem/bin:/opt/cray/dmapp/3.2.1-1.0400.3965.10.63.
gem/bin:/opt/cray/ugni/2.3-1.0400.4127.5.20.gem/bin:/opt/cray/udreg/2.3
.1-1.0400.3778.7.3.gem/bin:/opt/cray/MySQL/5.0.64-1.0000.4667.20.1/sbin
:/opt/cray/MySQL/5.0.64-1.0000.4667.20.1/bin:/opt/cray/sdb/1.0-1.0400.2
9394.12.45.gem/bin:/opt/cray/nodestat/2.2-1.0400.28140.5.3.gem/bin:/opt
/pbs/10.4.0.101257/bin:/opt/modules/3.2.6.6/bin:/stornext/home/carlos.b
astarz/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/bin/X11:/usr/X11R6/bin:/us
r/games:/usr/lib/mit/bin:/usr/lib/mit/sbin:/opt/pathscale/bin:/opt/nedi
t/5.5:/opt/cray/bin,
work_pre_agcm=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVA
R/datainout/agcm/pre,
inctime=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/bin/inctime,
PATHBASE=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm,
SetLinear=FALSE,XTPE_NETWORK_TARGET=gemini,ENV=/etc/bash.bashrc,
PKG_CONFIG_PATH=/opt/cray/pmi/3.0.0-1.0000.8661.28.2807.gem/lib64/pkgc
onfig:/opt/cray/xpmem/0.1-2.0400.30792.5.6.gem/lib64/pkgconfig:/opt/cra
y/dmapp/3.2.1-1.0400.3965.10.63.gem/lib64/pkgconfig:/opt/cray/gni-heade
rs/2.1-1.0400.4156.6.1.gem/lib64/pkgconfig:/opt/cray/ugni/2.3-1.0400.41
27.5.20.gem/lib64/pkgconfig:/opt/cray/udreg/2.3.1-1.0400.3778.7.3.gem/l
ib64/pkgconfig:/opt/cray/MySQL/5.0.64-1.0000.4667.20.1/lib64/pkgconfig,
XNLSPATH=/usr/share/X11/nls,PBS_O_MAIL=/var/mail/carlos.bastarz,
_=/opt/pbs/10.4.0.101257/bin/qsub,
work_pos_agcm_datain=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastar
z/G3DVAR/datainout/agcm/pos/datain,
work_model_agcm_datain=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bast
arz/G3DVAR/datainout/agcm/model/datain,
work_dataout=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datainout,
LS_COLORS=no=00:fi=00:di=01;34:ln=00;36:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=
40;33;01:cd=40;33;01:or=41;33;01:ex=00;32:*.cmd=00;32:*.exe=01;32:*.com
=01;32:*.bat=01;32:*.btm=01;32:*.dll=01;32:*.tar=00;31:*.tbz=00;31:*.tg
z=00;31:*.rpm=00;31:*.deb=00;31:*.arj=00;31:*.taz=00;31:*.lzh=00;31:*.l
zma=00;31:*.zip=00;31:*.zoo=00;31:*.z=00;31:*.Z=00;31:*.gz=00;31:*.bz2=
00;31:*.tb2=00;31:*.tz2=00;31:*.tbz2=00;31:*.avi=01;35:*.bmp=01;35:*.fl
i=01;35:*.gif=01;35:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.mng=01;35:*.mov=01;35:*.
mpg=01;35:*.pcx=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.png=01;35:*.ppm=01;35:*
.tga=01;35:*.tif=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.dl=01;35:*.gl=01;35:*.
wmv=01;35:*.aiff=00;32:*.au=00;32:*.mid=00;32:*.mp3=00;32:*.ogg=00;32:*
.voc=00;32:*.wav=00;32:,
home_g3dvar=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR,
home_cptec=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec,
WINDOWMANAGER=/usr/bin/gnome,CRAY_LLM_DIR=/opt/cray/llm/default,
home_agcm=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm,
work_pos_agcm_dataout=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.basta
rz/G3DVAR/datainout/agcm/pos/dataout,COLORTERM=1,IM=900,
CRAY_DMAPP_INCLUDE_OPTS=-I/opt/cray/dmapp/3.2.1-1.0400.3965.10.63.gem/
include -I/opt/cray/gni-headers/2.1-1.0400.4156.6.1.gem/include,
LABELFCT=2011010121,
work_gsi_datain_bkg=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz
/G3DVAR/datainout/gsi/datain/Bkg,
subt_gsi_datain=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DV
AR/datainout/gsi/datain,
FILEENV=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/run/scripts/agcm_scripts/
EnvironmentalVariablesMCGA,
FEXE=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/datainou
t/agcm/pre/exec,GetTracers=F,
FFTW_SYSTEM_WISDOM_DIR=/opt/xt-libsci/11.0.05,DISPLAY=localhost:38.0,
home_model_agcm_datain=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm
/model/datain,LANG=en_US.UTF-8,
subt_run_gsi=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/
datarun/gsi,
subt_grh_agcm_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastar
z/G3DVAR/datainout/agcm/grh/dataout,
subt_pre_agcm_run=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3
DVAR/datainout/agcm/pre/exec,
PBS_O_WORKDIR=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datainout/agcm/model/exec_NMC,
work_g3dvar=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR,
OSTYPE=linux,
dirfNameOutput=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVA
R/datainout/agcm/model/dataout/TQ0299L064/2011010112,
TARGETMODULES=/opt/modules/3.2.6.6/init/.targetmodules:craype-cpu-sand
ybridge:craype-network-aries:xtpe-barcelona:xtpe-interlagos:xtpe-istanb
ul:xtpe-mc12:xtpe-mc8:xtpe-netork-aries:xtpe-network-gemini:xtpe-networ
k-seastar:xtpe-shanghai:xtpe-target-cnl:xtpe-target-native:/etc/opt/cra
y/modules/site_targetmodules,XTPE_MC12_ENABLED=ON,
home_gsi=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/gsi,
work_pos_agcm_run=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G
3DVAR/datainout/agcm/pos/exec,hw=21,
home_pos_agcm_datain=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/p
os/datain,
CRAY_UGNI_POST_LINK_OPTS=-L/opt/cray/ugni/2.3-1.0400.4127.5.20.gem/lib
64,SHMEM_ABORT_ON_ERROR=1,hi=12,
public_agcm=/scratchin/grupos/assim_dados/home/gdad/public/AGCM,
BUILD_OPTS=/opt/cray/xt-asyncpe/5.07/bin/build-opts,hf=21,
CRAY_PMI_INCLUDE_OPTS=-I/opt/cray/pmi/3.0.0-1.0000.8661.28.2807.gem/in
clude,cpu_node=24,SSH_TTY=/dev/pts/19,
work_pos_agcm=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVA
R/datainout/agcm/pos,
subt_grh_agcm=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datainout/agcm/grh,
subt_pos_agcm_datain=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz
/G3DVAR/datainout/agcm/pos/datain,RUNPOS=No,
home_pre_agcm_scripts=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/
pre/scripts,
LOADEDMODULES=modules/3.2.6.6:pbs/10.4.0.101257:xtpe-network-gemini:Pr
gEnv-pgi/3.1.72:xt-totalview/8.9.2:totalview-support/1.1.2:pgi/12.2.0:x
tpe-mc12:tupa2/1.0.0:nodestat/2.2-1.0400.28140.5.3.gem:sdb/1.0-1.0400.2
9394.12.45.gem:MySQL/5.0.64-1.0000.4667.20.1:udreg/2.3.1-1.0400.3778.7.
3.gem:ugni/2.3-1.0400.4127.5.20.gem:gni-headers/2.1-1.0400.4156.6.1.gem
:dmapp/3.2.1-1.0400.3965.10.63.gem:xpmem/0.1-2.0400.30792.5.6.gem:hss-l
lm/6.0.0:admin-modules/1.0.2-1.0400.28857.5.1.gem:Base-opts/1.0.2-1.040
0.28857.5.1.gem:atp/1.4.2:xt-asyncpe/5.07:xt-libsci/11.0.05:xt-mpich2/5
.4.3:pmi/3.0.0-1.0000.8661.28.2807.gem,NDFCT0012=180h,
subt_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/
datainout,PREFIC=NMC,PREFIX=NMC,LOGNAME=carlos.bastarz,
PATH=/opt/cray/pmi/3.0.0-1.0000.8661.28.2807.gem/bin:/opt/cray/xt-asyn
cpe/5.07/bin:/opt/cray/atp/1.4.2/bin:/opt/pgi/12.2.0/linux86-64/12.2/bi
n:/opt/toolworks/totalview.8.9.2/bin:/opt/totalview-support/1.1.2/bin:/
opt/cray/llm/default/bin:/opt/cray/llm/default/etc:/opt/cray/xpmem/0.1-
2.0400.30792.5.6.gem/bin:/opt/cray/dmapp/3.2.1-1.0400.3965.10.63.gem/bi
n:/opt/cray/ugni/2.3-1.0400.4127.5.20.gem/bin:/opt/cray/udreg/2.3.1-1.0
400.3778.7.3.gem/bin:/opt/cray/MySQL/5.0.64-1.0000.4667.20.1/sbin:/opt/
cray/MySQL/5.0.64-1.0000.4667.20.1/bin:/opt/cray/sdb/1.0-1.0400.29394.1
2.45.gem/bin:/opt/cray/nodestat/2.2-1.0400.28140.5.3.gem/bin:/opt/pbs/1
0.4.0.101257/bin:/opt/modules/3.2.6.6/bin:/stornext/home/carlos.bastarz
/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/bin/X11:/usr/X11R6/bin:/usr/game
s:/usr/lib/mit/bin:/usr/lib/mit/sbin:/opt/pathscale/bin:/opt/nedit/5.5:
/opt/cray/bin,
subt_pre_agcm_scripts=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastar
z/G3DVAR/datainout/agcm/pre/scripts,
work_pre_agcm_datain=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastar
z/G3DVAR/datainout/agcm/pre/datain,
subt_model_agcm_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bast
arz/G3DVAR/datainout/agcm/model/dataout,
subt_model_agcm_run=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/
G3DVAR/datainout/agcm/model/exec,
subt_bkg_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3D
VAR/datainout/gsi/Bkg,NMSST=sstwkl,
work_obs_dataout=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3
DVAR/datainout/obs,
DK_suite=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/data
inout/agcm,CRAY_PRE_COMPILE_OPTS=-hnetwork=gemini,
home_pre_agcm_datain=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/p
re/datain,
work_pre_agcm_scripts=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.basta
rz/G3DVAR/datainout/agcm/pre/scripts,
INFODIR=/usr/local/info:/usr/share/info:/usr/info,
subt_pre_agcm_dataout=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastar
z/G3DVAR/datainout/agcm/pre/dataout,DIRGRADS=/opt/grads/2.0.a9/bin,
tmstp=1339163091,
MPICH_DIR=/opt/cray/mpt/5.4.3/xt/gemini/mpich2-pgi/109,
work_run=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/dat
arun,
work_model_agcm_dataout=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bas
tarz/G3DVAR/datainout/agcm/model/dataout,
subt_bkg_cptec=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVA
R/datainout/gsi/Bkg/cptec,CRAY_PRGENVPGI=loaded,
CRAY_SITE_LIST_DIR=/etc/opt/cray/modules,RCLOCAL_PRGENV=true,
usuario=carlos.bastarz,
work_logs_dataout=/scratchout/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G
3DVAR/out_log,
dirhome=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/pre,
PREFIXO=NMC,LABELFGS=2011010118,
DK=/scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR/datainout/
agcm,
CRAY_UDREG_POST_LINK_OPTS=-L/opt/cray/udreg/2.3.1-1.0400.3778.7.3.gem/
lib64,
home_grh_agcm=/stornext/home/carlos.bastarz/G3DVAR/cptec/agcm/grh,
XAUTHLOCALHOSTNAME=eslogin05,PBS_O_QUEUE=pesq
comment = Job run at Fri Jun 08 at 13:44 on (login5:ncpus=1)
alt_id = 8391
etime = Fri Jun 8 13:44:51 2012
accounting_id = 0x441000018cd
Submit_arguments = /scratchin/grupos/assim_dados/home/carlos.bastarz/G3DVAR
/datainout/agcm/model/exec_NMC/modg.NMC.TQ0299L064.eslogin05-eth0
